Analyse von Signalwegen

Zur Analyse von Signalwegen haben sich neben in vivo Methoden etliche in vitro Methoden in den letzten Jahren durchgesetzt. Eine der Methoden die immer weitere Verbreitung findet sind Reverse Phase Microarrays. Dabei wird der Extrakt von Zellen z.B. von einer Biopsie oder von Zellen mit und ohne Stimulus in einer Konzentrationsreihe auf Slides gespottet und mit spezifischen Antikörpern (z.B. phospho-spezifische Antikörper) inkubiert. Die Signalintensität erlaubt Rückschlüsse über Veränderungen der Proteine. Veränderungen können z.B. die Abundanz der Proteine sein oder post-translationale Modifikationen. Der Vorteil von Microarrays sind das geringe Probenvolumen, eine hohe Anzahl an technischen Replikaten und die Möglichkeit sehr viele Proben unter identischen Bedingungen zu testen. Dadurch lassen sich Zeitverläufe genauso untersuchen wie die Analyse von Signalwegen oder die »Reaktion« von Zellen (Gewebe) auf externe Stimuli, um damit Rückschlüsse auf den Wirkmechanismus ziehen.