Aptamer-Entwicklung

Maßgeschneiderte Aptamer-Entwicklung

Das Fraunhofer IZI-BB bietet Ihnen die komplette Bandbreite moderner SELEX-Verfahren – Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment.

© Fraunhofer IZI-BB
Automatisierung der Aptamerselektion mittels Magnetroboter. Für die SELEX gegen ein Protein werden magnetische, mit dem Target konjugierte Partikel mittels Magnetroboter sequentiell von Well zu Well transferiert. Nach der Inkubation mit der Startbibliothek erfolgen mehrere automatisierte Waschschritte zur Entfernung nicht- oder niedrigaffiner Sequenzen.

Unsere SELEX-Strategien sind individuell auf Ihr Target und Ihre Anwendung zugeschnitten und können sowohl voll- als auch teilautomatisiert umgesetzt werden.

So bieten wir Ihnen effiziente, schnelle und zuverlässige Lösungen für eine breite Palette von Anwendungen – von der Forschung bis zur Produktentwicklung.

  • Effiziente und zielgerichtete Aptamer-Entwicklung, abgestimmt auf ihre spezifischen Targets und ihre Anwendungen
  • Breites Target-Spektrum von kleinen Molekülen, Hapten, bis hin zu Proteinen, Toxinen, Viren, Bakterien oder eukaryotischen Zellen
  • Target-spezifische, individuell angepasste ssDNA- und RNA-Bibliotheken
  • Identifizierung hochaffiner und spezifischer Aptamere durch hauseigene Sequenzierung, bioinformatische Analyse und eine präzise Charakterisierung sowie gezielte Optimierung von Aptameren auf Basis detaillierter Bindungsanalysen   

Unser Angebot

  • Target- und anwendungsadaptierte SELEX-Strategien wie Zell-, Capture- und klassische (bead-basierte) SELEX für kleine Moleküle, Haptene, Proteine, Toxine, Viren, Bakterien und eukaryotische Zellen.
  • Voll- oder teilautomatisierte SELEX-Verfahren zur Gewährleistung hoher Reproduzierbarkeit und Effizienz.
  • Parallele Selektion gegen verschiedene Targets oder unterschiedliche Varianten eines Targets zur Identifizierung vielversprechender Hits.
  • Gezielt angepasste Pufferbedingungen an die jeweilige Anwendung oder an reale Matrizes zur Steigerung der Erfolgsrate und zur direkten Übertragbarkeit in nachfolgende Assays oder Sensoren.
  • Proprietäre Hochdurchsatz-Sequenzierung in Kombination mit bioinformatischer Auswertung für eine frühzeitige, datenbasierte Identifizierung der vielversprechendsten Aptamer-Kandidaten und eine optimale Steuerung und Überwachung des SELEX-Prozesses.
  • Hauseigene Charakterisierung mit modernen analytischen Verfahren zur Identifizierung von Bindern mit maximaler Affinität, Spezifität und optimaler Anwendungsrelevanz.

Charakterisierungsservice für Aptamere

Das Fraunhofer IZI-BB bietet einen Hochdurchsatz-Analyseservice für Aptamere, der sowohl die Identifizierung von Aptamer-Kandidaten als auch deren funktionelle Validierung unterstützt.

Mithilfe von Bead-, Platten- und zellbasierten Assays in Kombination mit modernsten Analysemethoden – einschließlich Goldstandard-Instrumenten wie SPR, ITC und FACS – liefern wir präzise Bindungs- und Kinetikdaten sowie Stabilitäts- und Funktionsprofile, die für die Validierung und gezielte Priorisierung von Aptamer-Kandidaten erforderlich sind.

  • Zuverlässige Qualitätssicherung: Validierung der Aptamer-Funktionalität
  • Zeitersparnis: Hoher Probendurchsatz für schnelle Ergebnisse
  • Flexibilität: Individuelle Auswahl der gewünschten Charakterisierungen
  • Modernste Instrumentation: Einsatz neuester Technologien für präzise Daten
  • IP-Schutz: Alle Ergebnisse und Rechte verbleiben beim Kunden

Unser Angebot 

  • Sequenzierung von einzelnen Klonen oder angereicherten Nukleinsäure-Pools (spezialisiert auf kurze Nukleinsäuren < 100 nt)
  • Analyse der Diversität von Nukleinsäure-Pools (DANA)
  • Hochdurchsatz Screening von Bindungskonstanten mittels Bead-basiertem Plattenassay
  • Affinitäts- und Interaktionsanalysen mittels ‚electrophoretic mobility shift assay‘ (EMSA), Durchflusszytometrie (FACS) und Fluoreszenzbasierter Aptamer Bindungsassay (FLAA)
  • Bestimmung von Bindungskonstanten und -kinetik mittels Oberflächenplasmonenresonanz (SPR)
  • Bestimmung von Bindungskonstanten mittels Mikroskaliger Thermophorese (MST) oder isothermaler Titrationskalorimetrie (ITC)
  • Analyse der Aptamer-Bindungsepitope zur präzisen Bestimmung der Zielbindungsstellen